Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms