Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms