Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmfrQ9R049 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms