Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afyQ9QZQ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afyQ9QZQ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.1 ms