Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psma6Q9QUM9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms