Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms