Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pbdc1Q9D0B6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms