Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms