Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ncbp2Q9CQ49 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms