Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms