Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms