Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap4Q8BMK4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms