Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms