Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc57Q6PHN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms