Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms