Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms