Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CC2D1BQ5T0F9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CC2D1BQ5T0F9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms