Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms