Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCINQ13939 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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