Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms