Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tff1Q08423 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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