Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms