Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CckbrP56481 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms