Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LmnaP48678 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LmnaP48678 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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