Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CratP47934 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CratP47934 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CratP47934 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms