Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms