Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms