Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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