Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm21887J3QQ04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms