Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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