Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21818J3KMS6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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