Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc171E9Q1U1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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