Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm3250E9Q1M3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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