Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms