Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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COPS7AQ9UBW8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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