Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms