Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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