Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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