Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPROQ16827 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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