Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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