Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CDKN3Q16667 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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