Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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