Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SIX1Q15475 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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