Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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