Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRT31Q15323 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRT31Q15323 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRT31Q15323 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRT31Q15323 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRT31Q15323 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms