Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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GPNMBQ14956 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GPNMBQ14956 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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