Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms