Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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