Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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