Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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